Identification du genre

Localisation

Lyra > Laboratory > Analysis

🎯 Objectif

Cet article vous guide dans l'analyse qualitative de vos prélèvements microbiologiques. L'identification du genre intervient après le dénombrement. Elle permet de caractériser les colonies détectées (bactéries ou levures/moisissures) en les regroupant par typologie, en documentant leurs aspects macroscopiques et microscopiques, et en leur assignant un genre précis issu de votre base de données.

☑️ Prérequis

Avant de réaliser votre identification, assurez-vous que :

• ☑️ Un dénombrement microbiologique a été réalisé sur une ou plusieurs géloses
• ☑️ Vous disposez de la fonctionnalité "Analysis" sous le module Laboratory
• ☑️ Vous avez la licence "Pro"

📖 Description

Cycle de vie d'une identification

Une identification du genre suit un flux de travail en 3 étapes obligatoires :

┌─────────────┐ ┌─────────────┐ ┌─────────────┐ │ 1 │ → │ 2 │ → │ 3 │ │Préparation│ │ Identification │ │ Approbation └─────────────┘ └─────────────┘ └─────────────┘ Qui performe ? Observation ? Résultats

1. Préparation : Assignation des responsables.

2. Identification : Regroupement des colonies et caractérisation.

3. Approbation : Validation finale des résultats.

Préparation de l’identification du genre

Dans le tableau de bord de la campagne, repérez la colonne "Identification du genre". Si le dénombrement a révélé des contaminants, le bouton + devient actif. Cliquez dessus pour démarrer.

La phase de préparation permet de sélectionner qui intervient

Actions disponibles :

• Supprimer un utilisateur en cliquant sur la corbeille.
• Cliquez sur "Choisir un utilisateur" dans le menu déroulant pour ajouter d'autres intervenants.

⚠️ Seuls les utilisateurs ici seront disponibles lors de l'encodage. Cela garantit la traçabilité et évite les erreurs de saisie.

Après sélection des utilisateurs, cliquez sur SUIVANT

Identification du genre

Cette étape consiste à "trier" les colonies comptées. Vous ne traitez pas chaque colonie individuellement, mais par "Groupes" de germes identiques.

Vous pouvez ajouter autant de groupe d’identification que nécessaire pour réaliser votre identification.

Création de groupes

1. Cliquez sur le bouton AJOUTER UN GROUPE.
2. Une fenêtre modale s'ouvre. Renseignez :
   • Type : Sélectionnez la nature du germe (ex: Bactérien ou Fongique).
   • Nombre de CFU : Indiquez combien de colonies correspondent à ce groupe.
   • Utilisateur : Utilisateur en charge de l’ajout du groupe d’identification.
   • Date : Horodatage de l’ajout du groupe d’identification (automatiquement mis à jour).
3. Cliquez sur SAUVEGARDER. Le groupe apparaît sous forme de carte.

Description (Optionnel) Pour affiner l'analyse, vous pouvez ajouter des observations textuelles sur le groupe créé :

• Observation macroscopique : Cliquez sur DESCRIPTION pour noter les caractéristiques visuelles de la plaque ( taille, relief, aspect, consistance, couleur, aspect à la lumière…).
• Observation microscopique : Cliquez sur DESCRIPTION pour noter les résultats de laboratoire (morphologique, groupement, gramme ..). Il est possible de cocher la case "Est une levure" si applicable.

Sélection du genre C'est l'étape de conclusion de l'analyse.

1. Sur la carte du groupe, cliquez sur SÉLECTIONNER UN GENRE.
2. Dans la fenêtre de recherche, tapez ou sélectionnez le nom du germe identifié (ex: Bacillus Sp, Staphylococcus epidermidis).
3. Validez.

Approbation de l’identification

Une fois tous les germes identifiés, l'écran de synthèse s'affiche.

• Vérifiez la cohérence entre le nombre de colonies comptées (Dénombrement) et le nombre de colonies identifiées.
• Le système affiche le résumé des identifications réalisées.
• Cochez la case "Je certifie la conformité des données" et cliquez sur APPROUVER pour clôturer l'analyse.

🔐 Permissions requises